FUNDESCAN surge en 1996 como Fundación Canaria para el Desarrollo Social, promovida por la Unión General de Trabajadores de Canarias a partir de la experiencia acumulada desde 1987 con Fundescoop, una fundación de ámbito estatal. Desde entonces, la Fundación ha ampliado y diversificado sus ámbitos de trabajo, profundizando en las acciones de formación y la orientación profesional de los trabajadores, en los análisis sectoriales y económicos, y la promoción de las distintas dimensiones de la economía social. Asimismo, la Fundación ha entrado decididamente en la cooperación internacional, tanto en relaciones transnacionales a través de programas e iniciativas promovidas por la Unión Europea, como en la cooperación al desarrollo, especialmente con aquellos países que tienen vínculos históricos, culturales y geográficos con Canarias.